根据我国《民法典》，婚内财产协议是夫妻双方就财产的归属、管理等事项达成的约定，具有一定的法律效力。然而，当协议中约定了违约金条款时，其是否有效引起了广泛的争议。对于这一问题，我们需要从相关法律法规、司法解释以及实践经验等方面进行综合分析。
首先，根据《民法典》第1555条的规定，夫妻可以协商约定婚内财产的权益、负担等事项，包括约定违约金的数额及违约情形。这表明，婚内财产协议中约定违约金是被法律允许的，具备一定的合同效力。然而，违约金的有效性还需考虑其他因素。
其次，婚内财产协议作为一种特殊的合同关系，其效力受到《合同法》的适用。依照《合同法》第54条的规定，当事人约定的违约金不得超过违约方应当支付的损失的预估数额。因此，在婚内财产协议中约定的违约金应当合理，不能超过另一方违约所造成的损失的合理范围。此外，根据实践经验来看，违约金的金额应当与协议的目的相匹配，不能过高或过低。过高的违约金可能被认为是对违约方的不合理惩罚，从而引发无效性的争议。而过低的违约金则可能无法起到约束违约行为的作用，降低协议的约束力。因此，违约金的合理性和公平性是评判其有效性的重要因素。
总之，婚内财产协议中约定的违约金是否有效需要根据具体情况来界定。如果违约金的约定符合法律规定、合理、公平，并且经过双方自愿达成，那么在一般情况下，应当认定为有效。但在具体争议中，还需要考虑协议的目的、违约行为的严重性、损失的预估以及社会公序良俗等因素。因此，在起草和签订婚内财产协议时，双方应当慎重考虑违约金条款的约定，遵循法律规定，确保协议的有效性和公平性。